本次修正重點包括增列露營場產生污水未妥善收集處理污染行為之違規態樣及計算基準、加重未達本法公告事業管制規模之食品業等製程排放廢（污）水於水體或沿岸規定距離之罰鍰、繞流排放及3年內首次違規但情節嚴重均不適用得減輕情狀、明確疏漏應變措施不足仍致污染水體者之裁罰等。
環境部強調，本次修正係於現行水污染防治法授權之罰鍰範圍內，務實考量執法需求，予以訂定罰鍰額度計算方式，做為環境部及縣市環保機關裁罰參考依據，以強化違反水污染防治法的處罰執行力，維護河川和地面水體之水質。